ワシントン大学（UW）の研究者たちは、有害藻類ブルーム（HAB）を予測するための生化学的マーカーを特定したと、最近「Nature」というジャーナルに発表した報告によって明らかにされました。
有害藻類ブルームは、観光、公共の健康、海洋生物、漁業などに対して大きな脅威を与えており、これが研究の主な目的の一つです。UWのゲノム研究の准教授であるブルック・ナンは、ブルームの前の動態を明らかにし、最終的にはHABが発生する際の兆候に基づいて警告システムを構築することを目指しています。
「私たちが見ているのは、… 浮遊性またはプランクトンバクテリアが、有害藻類ブルームの24時間から72時間前にプロテオームを変化させることです。それは、水柱に何らかの重要な変化があることを示しています。」とナンは述べました。
プロテオームとは、ある生物が持つ全てのタンパク質の集合体のことです。変化の原因はまだ不明で、溶解した化学物質の結果か、複数の要因の組み合わせかもしれません。ナンの研究室であるエマ・ティミンズ・シフマンは、これに関するモデルを現在作成しています。
「私は今、さまざまな栄養素のパターンやフィトプランクトンの量、さまざまなバクテリアがどのように相互作用し、時間とともに変化するかを見ています。これらにパターンがあるかどうかを確認しています。」とティミンズ・シフマンは説明しました。
また、UWの研究者マイケル・リッフルも、ゲノム科学部門での経験を生かしてこのプロジェクトに重要な貢献をしました。彼は、ブルームの原因について確定的な結論に至るのが難しい理由を以下のように述べています。
「私はそれを、非常に複雑なドミノの連鎖として考えています。そして、どのドミノが最初に倒れるかが分からないのです。これらのバクテリアレベルを観察すると、どれほど深くそのドミノの連鎖を見ているのかわからないのです。」
研究者たちは、地域の生態系にどのように影響するかを確実に知るためには、まだ多くの作業が必要であると述べています。彼らは、分類学の階層でクラスレベルでのペプチドを調査しましたが、まだ種レベルには到達していません。
「クラスレベルでの研究の利点は、他の生態系でも非常に簡単に適用できる可能性があることです。」とナンは述べました。「実際に他の生態系でも確認するまでは、それはわかりません。」
約1年前、研究チームはブルームの動態および維持をさらに探求するために、国立科学財団（NSF）から追加の資金をリクエストしました。2024年9月に承認された4年間の助成金には、ロードアイランド大学との共同研究が含まれています。
チームの発見は、2025年6月に国立衛生研究所（NIH）によって今月の研究として特集され、バイオマーカーの検証を続けるためにR01（申請機構）を提出するよう励まされました。
彼らは現在、助成金の提案書を作成している段階ですが、政府の資金調達の障壁によってこれが妨げられています。
「連邦政府の動きは、すべての分野、セクター、環境で科学者の研究能力に影響を及ぼしています。」とナンは述べました。「トランプ政権は、NIHを含む科学への資金提供を数十年で最も低い水準に削減しました。」
「提案書を書くべきなのに、すべてが少し保留となっています。NIHや資金の機会がどうなるかを見守っています。」とナンは付け加えました。
ナンは、提案書を書くことが非常に時間がかかり、協力的で簡潔であるべきだと強調しました。
「これらの提案書を書くのは非常に労力がかかる作業であり、実際の研究から多くの時間を奪っています。」とナンは述べました。「私たち10人全員が将来の作業を行うために最適な場所を見つけるために協力します。また、資金がない状態でもサイトの許可を調整する必要があります。さらに、詳細な予算を作成する必要があります。それに対する間接費がまだ不明です。」
画像の出所：dailyuw